一體式超聲波破碎儀用于多種動植物、病毒、細胞、細菌及組織的破碎，同時可用來乳化、分離、勻化、提取、消泡、清晰、納米材料的制備、分散及加速化學反應等。該設備被廣泛用于生物學、微生物學、物理學、動物學、農學、制藥、化工、污水處理、納米材料等領域,也可用于產生波提取、超聲波材料制備、超聲波萃取、超聲波乳化等。
破碎大腸桿菌用于提取表達外源蛋白，在使用一體式超聲波破碎儀之前，用PBS懸浮，然后再破碎效果較好，其作用還是很明顯的，對其他的一些細菌同樣起作用，比如鏈霉菌。
細菌沉淀直接加樣品1 buffer，再加5μl的巰基乙醇，混勻，離心，煮沸10min，直接上樣，染色脫色步驟：
將膠放入適量的染色液微波爐里加熱1min(下次適當補點醋酸即可),將染色液換成大量的水(自來水即可)在微波爐煮10min就可以。在表達重組蛋白后用超聲波破碎細胞，采用冰浴，400w，破2s停1s，但是不一會就產生大量泡沫，影響了破碎功率，pbs和tris緩沖液都是這樣，最后都是破碎不*，而蛋白就在這些未破碎的細胞中。
相關問題探討：
1.試驗中產生氣泡：因為探頭位置沒放好。超聲波破碎儀探頭一定要接近底部約1cm。功率根據儀器不同會有所不同，但可通過觀察液面，有波動但不要太劇烈就好。
2.破3s停10s，破碎20-30個循環觀察效果。
3.探頭位置擺放要注意，聽聲音如果不對的話就要及時調整。另外可從菌濃度方面考慮。在使用超聲波破碎時試著加大體積,振幅最好不要超過60%。
4.嘗試超8s停8s,對有些菌體蛋白來說，通常方法很難散熱，導致蛋白變性產生氣泡，可停頓時間稍長一些，這種情況多見于包涵體形式的蛋白。如果換用一體式超聲波破碎儀來進行工作，由于熱耗較小，停頓周期可適當減小。
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